新疆老科协内设六个专业委员会，分别是：决策咨询专门委员会（新疆老科协智库）、学术研究专门委员会（下设科学大讲堂）、科学普及专门委员会（下设科普报告团）、健康服务专门委员会（下设医疗服务健康保健报告团）、“三农、双创”专门委员会、组织宣传专门委员会（“新疆老科协”会刊编委会）。

截至目前，新疆老科协所属团体会员单位有：

中科院新疆分院老科协 、新疆农科院老科协 新疆农业大学老科协、新疆地震局分会、新疆有色金属公司分会： 宝钢集团新疆八钢公司分会、乌鲁木齐铁路局分会

各地州市老科协有：伊犁州老科协、乌鲁木齐市老科协、阿勒泰地区老科协、塔城地区老科协、博尔塔拉州老科协、哈密市老科协、吐鲁番市老科协、巴音郭楞州老科协、阿克苏地区老科协、和田地区老科协、喀什地区老科协、克孜勒苏州老科协。